全國政協(xié)委員賈康在《關(guān)于加快環(huán)境保護(hù)稅立法》的提案中建議：

一是順應(yīng)總體財稅改革方向和部署加快立法、及早開征環(huán)境保護(hù)稅。在穩(wěn)定宏觀稅負(fù)的前提下開征環(huán)境保護(hù)稅，可在環(huán)境費(fèi)改稅、改革資源稅的同時，相應(yīng)減少企業(yè)所得稅、關(guān)稅等稅負(fù)。同時，建議環(huán)境保護(hù)稅全部進(jìn)入地方稅收入，作為一般預(yù)算收入統(tǒng)籌管理，不延續(xù)“專款專用”的老路。為了解決基層環(huán)保官員靠排污費(fèi)發(fā)工資的情況，從編制和預(yù)算上向基層環(huán)保部門適當(dāng)傾斜以“收支兩條線”規(guī)范強(qiáng)化基層環(huán)保監(jiān)管。

       二是適當(dāng)提高環(huán)境保護(hù)稅稅率并縮小免征范圍。可以參照一些省市已自行調(diào)高的環(huán)境費(fèi)率作優(yōu)化設(shè)計，如北京市二氧化硫、氮氧化物、化學(xué)需氧量排污費(fèi)水平均已提高到每千克10元，遠(yuǎn)高于征求意見稿中每千克1.26元、1.26元和1.4元的水平。據(jù)測算，我國電廠脫硫脫硝成本分別為每千克2元和5元，均高于征求意見稿中每千克1.26元的水平。如果不調(diào)高征收標(biāo)準(zhǔn)，開征環(huán)境保護(hù)稅對減排的促進(jìn)作用會大打折扣。此外，不建議對非規(guī)模化養(yǎng)殖的農(nóng)業(yè)、達(dá)標(biāo)的城鎮(zhèn)污水處理廠和生活垃圾處理廠免征環(huán)境保護(hù)稅。2013年，城市污水排放占我國廢水排放總量的近七成；2014年到2020年預(yù)計我國城鎮(zhèn)生活垃圾將新增3162萬噸；2014年農(nóng)業(yè)貢獻(xiàn)的化學(xué)需氧量和氨氮排放占到了總量的48%和32%。這三類污染源從絕對量和相對量上都非常可觀，建議取消與其相關(guān)的免征規(guī)定。

三是設(shè)計清晰的部門協(xié)調(diào)分工。在已有征求意見稿基礎(chǔ)上，進(jìn)一步細(xì)化征收管理流程，明確納稅單位、稅負(fù)和環(huán)保部門的責(zé)任義務(wù)。可參考環(huán)保部門現(xiàn)已擁有的排污申報及核定數(shù)據(jù)作為核定環(huán)境保護(hù)稅應(yīng)納稅額的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)，避免不必要的重復(fù)工作給企業(yè)和政府部門帶來過多額外負(fù)擔(dān)。今后由企業(yè)向環(huán)保部門申報污染物、環(huán)保部門審核污染物排放數(shù)據(jù)、企業(yè)根據(jù)審核后的排污數(shù)據(jù)向稅務(wù)部門申報環(huán)境保護(hù)稅、由稅務(wù)部門征收，同時各部門實現(xiàn)信息共享，緊密合作。